Cuando el paÍs estaba en plena tensión por el avance de la pandemia y ad portas de la cuarentena nacional, Aníbal Fernández de Soto dejó la Vicepresidencia de Desarrollo Sostenible y Ambiental, algo inusual en los puestos directivos de Ecopetrol. Aparentemente se le cobró su cercanía con Juan Manuel Santos, gobierno en el que ocupó distintos cargos y en distintos sectores; el último fue el Viceministerio de defensa con Luis Carlos Villegas como Jefe de la Cartera, de donde pasó a la Vicepresidencia de Ecopetrol el 5 de septiembre del 2018.
Aníbal Fernández de Soto Fue nombrado por Felipe Bayón quien había entrado a reemplazar a Juan Carlos Echeverry en la recta final del gobierno Santos, pero fue ratificado por la nueva junta directiva conformada por el Presidente Duque. Este marzo Fernandez de Soto fue retirado del cargo por el propio Bayón quien lo había nombrado y hasta el momento no ha sido escogido su reemplazo.Por el momento fue encargada Isabel Ampudia, funcionaria de la entidad; esta vicepresidencia es del resorte directo de la presidencia de Ecopetrol.
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