El General (r) de la Policía y actual vicepresidente Óscar Naranjo fue citado a juicio junto a la cúpula de las Fuerzas Armadas de 2008 por el Tribunal de Garantías de Sucumbíos, en Ecuador, por la operación militar en la que murió el excomandante guerrillero Raúl Reyes. Según la investigación, que comenzó en 2011, Colombia violó la soberanía ecuatoriana al bombardear el campamento del entonces número dos de las FARC en donde murieron 22 guerrilleros y cuatro ciudadanos mexicanos que se encontraban allí por cuestiones académicas.
En el proceso también están involucrados el excomandante de las Fuerzas Militares, Freddy Padilla; del Ejército, Mario Montoya; de la Marina, Guillermo Barrera; y de la Fuerza Aérea, Jorge Ballesteros. Si los comandantes no se presentan voluntariamente, la justicia ecuatoriana podría expedir órdenes de captura para hacerlos comparecer en juicio. A pesar de que las relaciones diplomáticas entre los dos países mejoraron desde la crisis en la que incluso Uribe rompió con el expresidente Rafael Correa, este llamado revive la investigación que había estado quieta por varios años.
