El último nombramiento que consiguió César Pardo Villalba, fue el de ser gerente del Pacto Agrario que se creo como respuesta al Paro nacional del 2013 y cuya estructura se consolidó con la llegada de Pardo en marzo de 2014, por decisión del ministro Rubén Dario Lizarralde. Con unos pocos meses de anterioridad había sido designado, en diciembre del 2013, miembro de la Junta Directiva del Banco Agrario. La remuneración por su rol en el Pacto Agrario la asume la Corporación Colombia Internacional, una entidad mixta publica-privada en la que el gobierno a través de cinco entidades tiene la mayoría. Pardo, a la vez es presidente ejecutivo del gremio de los productores de algodón, Conalgodones, cargo en el que fue nombrado en abril de 2013.
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