Sus actuaciones como gobernador del Meta y especialmente el desfalco de la refinería Llanopetrol que ya mandó a la cárcel a Ricardo Rodríguez, gerente de la firma, Hernando Martínez Aguilera, exgerente de planeación, Luz Stella Casasfranco, exjefe de la oficina de asuntos contractuales, pusieron contra las cuerdas a Alan Jara.
Además Jairo Iván Frías, rector de la Universidad de los Llanos, detenido también por la Fiscalía, se convertirá en testigo clave contra el exgobernador.