A diferencia de Medellín (Antioquia), el antiguo eje cafetero y los santanderes, donde el triunfo del candidato de Uribe y sus aliados conservadores y cristianos fue abrumador, y de Barranquilla, donde el costeño Petro le sacó diez puntos a Duque, la votación más pareja en las ciudades y departamentos con mayor potencial electoral se presentó en Bogotá, donde el paisa Fajardo con 1.240.799 (33,77%) le ganó con moderada ventaja a Petro quien logró 1.098.478 (29,90%) y con mayor diferencia al ‘rolo de origen paisa’, Duque, con 983.931 (26,78%), al igual que en Cali y el Valle del Cauca.
Así, en Cali, ganó Fajardo con 283.146 votos para el 32,51%, seguido de Duque con 246.460 para el 28,30 % y de Petro con 229.929 equivalentes al 26,40%. Sumando los municipios del departamento del Valle del Cauca, Duque con 523.898 votos (29,97%) por casi 24.000 votos le ganó a Fajardo con 499.925 (28,60%) y a Petro quien obtuvo 429.929 (26,40%).
En la costa atlántica Petro ganó en su tierra natal Córdoba con cerca de 250.000 votos para el 42,28%, Sucre con 154.205 (44,23%) Atlántico con 331.687 sufragios para el 38,52% y en la Guajira con 85.149 votos para el 43,07%, mientras en Bolívar, Magdalena y Cesar ganó Duque por estrecha diferencia. Sumando los departamentos del Caribe, el ganador fue Petro y para Fajardo su talón de Aquiles.
En el resto de departamentos con costas en el océano Pacífico, y más afectados por la violencia guerrillera, el narcotráfico y la minería ilegal, ganó Petro así: en el Cauca con 230.019 votos para el 49,24%, en Nariño con 238.683 equivalentes al 46,33% y en Chocó con casi 50.000 votos para el 42,96%.
En Popayán ganó Petro con 52.101 votos para el 38,53%, mientras Duque con 35,301 sufragios para el 26,11% por menos de mil votos superó a Fajardo quien obtuvo 34.362 para el 25,40%. En el departamento del Cauca a pesar de contar con el apoyo de los representantes a la Cámara por el partido liberal Piso y Bonilla, por el senador Temístocles Ortega de Cambio Radical y por el supuesto respaldo del gobernador Oscar Campo quien es investigado por la Procuraduría según informe de Noticias Uno, Germán Vargas Lleras, obtuvo 42.032 votos equivalentes al 8,96%. En todo el Cauca por Humberto de la Calle sólo votaron 13.128 a pesar de que en las elecciones para el Senado y Cámara por este partido fueron electos el senador Luis Fernando Velasco y los representantes Carlos Bonilla y Crisanto Piso.
Tanto en las grandes ciudades como en los departamentos con menos potencial electoral predominó el voto independiente de la voluntad de los jefes regionales que aseguraron sus votos en las elecciones de marzo para el Congreso. Esta tendencia se manifestó con mayor evidencia en la costa atlántica donde el clan Char y los caciques locales no pudieron jalonar a Germán Vargas Lleras.
Aunque los jefes departamentales y regionales de los alicaídos partidos Liberal, Cambio Radical, de la “U” y Conservador se aprestan a enfilarse con Duque para asegurar sus cuotas de poder, lo más probable es que sus bases actúen sin su tutoría, tal como lo evidenciaron en la primera vuelta, aunque para que Petro gane tendría que contar con el respaldo de la mayoría de los que respaldaron a Fajardo y de La Calle, además de motivar a buena parte del 46% de abstencionistas que el pasado domingo no acudieron a las urnas.