El exministro conservador ha estado presente en los momentos claves del proceso, en un principio sin la aprobación explícita del presidente Santos, pero recientemente ha sido incluido en la subcomisión jurídica por solicitud de las Farc. Desde allí participó en la elaboración del acuerdo de 75 puntos anunciado por el presidente Santos y Timochenko en La Habana, pero desde que comenzaron a salir a flote las diferencias entre el gobierno y las Farc, Leyva prácticamente entró en cónclave con los negociadores de las Farc en Cuba. El 15 de diciembre de 2015, durante el anuncio oficial del acuerdo, su rostro apareció en televisión siempre al lado del jefe negociador de las Farc, Iván Márquez.
Leyva fue clave para que las Farc aceptaran pagar penas de entre 2 y 12 años, y no solo ha sido el hombre de confianza de las Farc sino un interlocutor con el expresidente Álvaro Uribe. Las Farc serán juzgadas por un Tribunal Especial, y dependiendo de la gravedad de sus delitos y de su voluntad de confesar y reparar a las víctimas, podrán pagar entre dos y 12 años de pena, con restricción de la libertad en un lugar diferente a una cárcel.
