En los pasillos del Congreso muchos identifican a Juan Pablo Duque, quien fue designado Secretario General de la Comisión de Acusaciones, como el enlace del Fiscal General Eduardo Montealegre con el legislativo. Duque llegó al cargo apoyado por el Fiscal y con el visto bueno de la casa Gaviria, ya que fue precisamente Simón Gaviria quien lo postuló para el cargo. Es recordado por haber hecho el lobby en esta comisión para que se frenara la investigación contra el fiscal Montealegre que se le había abierto a raíz de las denuncias de la Contralora Sandra Morelli por los pagos que Montealgre habría recibido de parte de Saludcoop cuando ya ejercía como Fiscal General. Esta comisión, encargada de investigar a los expresidentes de la República y los funcionarios con fuero especial como el Fiscal y los magistrados de las cortes, quedó integrada por los siguientes representantes a la Cámara:
P. Conservador: Nicolás Echeverri, Humprey Roa y Germán blanco
P. Liberal: Julián Bedoya, Alejandro Chacón y Edgar Gómez
Cambio Radical: Carlos Cuenca y Hernando Padaui
Alianza Verde: Angélica Lozano
Centro Democrático : Federico hoyos y Edward Rodríguez
La U: Berner Zambrano, Carlos Edward Osorio, Nicolás guerrero
Cien por ciento Colombia: Yahir Acuña
