El representante en el Consejo Superior de la Universidad Nacional tiene un peso especial y durante los últimos 3 gobiernos se había dado continuidad a través del nombre de Pablo Orozco. Se trata de un científico vinculado a la Nacional de vieja data, quien asumió la gerencia de la Empresa de Energía de Bogotá durante la Alcaldía de Antanas Mockus. Duque se decidió por el médico Julio César Castellanos, cercano al ministro de Salud Fernando Ruiz y quien es además director del Hospital San Ignacio. Él ahora lo presentará en esta instancia.
Así quedó conformado el Consejo Superior:
- María Victoria Angulo González: Ministra de Educación Nacional – Presidenta del Consejo
- Luis Fernando Pérez Pérez: Viceministro de Educación Superior
- Dolly Montoya Castaño: Rectora de la Universidad Nacional de Colombia
- Julio César Castellanos Ramírez: Designado por el Presidente de la República
- Carlos Costa Posada: Designado por el Presidente de la República
- Fernando Sánchez Torres: Representante de los Ex-Rectores. También es miembro del Consejo Superior de la Universidad Central
- Eduardo Aldana Valdes: Representante del CESU y exrector de la Universidad de Los Andes
- Carlos Eduardo Naranjo Quiceno: Decano de la Facultad de Artes Sede Bogotá Designado por el Consejo Académico
- Beatriz Martínez de Vargas: Representante de los profesores
- Jennifer Dalhey Pedraza Sandoval: Representante Estudiantil
- Carmen Alicia Cardozo de Martínez: Secretaria General de la Universidad Nacional de Colombia