El gobierno le pidió la renuncia por haber hecho público el documento de Planeación Nacional, entidad que depende del ministro Mauricio Cárdenas, en el que le anunciaban el recorte en $125 mil millones del presupuesto de Colciencias. La directora Paula Arias estaba lista para su intervención en la Convención Científica Colombiana en Cartagena, cuando 15 minutos antes, recibió la fatídica información de parte del Ministerio de Hacienda y de Planeación Nacional. Arias consideró que su obligación era hacer público el dato y aprovechó su intervención para desahogarse. Inmediatamente desde la Presidencia, se le hizo saber que no convenía que continuara en el cargo y ella misma ha dicho que la invitaron a renunciar por "bocona". Esta es la carta donde le comunican el recorte del presupuesto de la entidad:
