El presidente Duque le dio bastante autonomía a los ministros para conformar sus equipos inmediatos. Por eso empiezan a formalizarse los nombramientos de los viceministros Adriana Mejía, quien aunque tiene experiencia en el tema, actualmente se desempeña como directora ejecutiva del Instituto de Ciencia política creado por Hernán Echavarria; y también el del economista e historiador cordobés Javier Pérez Burgos, que tendrá la responsabilidad del desarrollo rural como viceministro de Agricultura. Otro de los funcionarios del gobierno Santos, que como su exjefe Luis Fernando Mejía, que pasa a Fogafin, sobrevivió al cambio de gobierno.
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