El conflicto limítrofe entre Antioquia y Chocó por el municipio de Belén de Bajirá ha puesto en el ojo del huracán al Instituto Geográfico Agustín Codazzi. Al frente de la institución ha estado, desde el 2013, el político liberal, Juan Antonio Nieto Escalante, quien ha ocupado, entre otros cargos, el de la Secretaria Distrital de Ambiente de Bogotá. Fue alcalde encargado de la ciudad en el 2009 por un viaje que realizó Samuel Moreno a México, fue Registrador Distrital y Contralor Delegado.
En su extensa hoja de vida no aparece información suficiente de que pueda tener los requisitos técnicos para ocupar la dirección de un Instituto Geográfico con las exigencias del Agustín Codazzi.